#!/bin/bash
#PBS -N cl2d
#PBS -q em
#PBS -S /bin/bash
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -l mem=126gb
#PBS -l walltime=48:00:00

cd $PBS_O_WORKDIR
nproc=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)

module purge
module load myami

runXmippCL2D.py --description="trying to see if I can recreate Gabe's bug" --stack=11 --lowpass=20 --highpass=2000 --num-part=15417 --num-ref=256 --bin=1 --max-iter=15 --nproc=16 --fast --classical_multiref --correlation --commit --rundir=/gpfs/group/em/appion/rmhoff/14jul28b/align/cl2d2 --runname=cl2d2 --projectid=444 --expid=13761 --jobtype=partalign

